| Versio | 2.1.2 |
|---|---|
| Kustantaja | BioSolveIT |
| Julkaisupäivä | 2.5.2013 |
| Lisäyspäivämäärä | 2.5.2013 |
| Os vaatimukset | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Vaatimukset | None |
| Latauksia yhteensä | 25 |
| Hinta | Free |
Kuvaus
FlexS ennustaa yhden ligandin konformaation ja orientaation suhteessa toiseen. FlexS:ssä referenssiligandin oletetaan olevan jäykkä, joten se tulisi antaa konformaatiossa, joka on samanlainen kuin sidottu tila. FlexS:n superpositio-algoritmi vaatii vain vähän manuaalista puuttumista. Voit integroida tämän tiedon FlexS:n laskelmiin suorittamalla yksittäisiä vaiheita manuaalisesti. Näin ollen FlexS on suunniteltu vuorovaikutteiseen työhön ligandiparien parissa sekä ligandipohjaiseen virtuaaliseulontaan. FlexS:n kaksi pääsovellusta ovat ligandin superpaikannus (esim. CoMFA/QSAR) ja virtuaalinen seulonta. Jos sinulla on proteiini ja siihen sitoutuva pieni molekyyli (ns. referenssiligandi), mutta proteiinin rakennetta ei ole, voit pitää vertailurakenteen aktiivisen kohdan negatiivisena sormenjäljenä. FlexS määrittää testin ja vertailurakenteen samankaltaisuuden kohdistamalla ne. Virtuaaliseulonnassa sinulla on vertailuligandi ja joukko yhdisteitä ja olet kiinnostunut priorisoimaan yhdisteet kokeelliseen testaukseen.