| Versio | 1.1.5 |
|---|---|
| Kustantaja | MultiGeneBlast |
| Julkaisupäivä | 3.4.2013 |
| Lisäyspäivämäärä | 4.4.2013 |
| Os vaatimukset | Windows 2003, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Vaatimukset | None |
| Latauksia yhteensä | 95 |
| Hinta | Free |
Kuvaus
MultiGeneBlast on avoimen lähdekoodin työkalu, joka perustuu NCBI GenBank -proteiinimerkintöjen FASTA-otsikoiden uudelleen muotoiluun, jonka avulla se voi jäljittää niiden lähdenukleotidit ja -koordinaatit. MultiGeneBlast voi auttaa tällaisten monigeenisten osien havaitsemisessa synteettisen biologian projekteissa. Sen tulosteen perusteella voidaan luoda synteettinen operonikirjasto tunnistamaan ne operonit, joiden funktio on lähinnä käyttäjän haluamaa. Tämä työkalu tarjoaa mahdollisuudet tunnistaa kaikki homologiset genomialueet yhdistämällä kunkin geenin yksittäisten BlastP-ajojen tulokset ja lajittelemalla genomialueet mistä tahansa GenBank-merkinnästä osumien määrän, synteenian säilymisen ja kumulatiivisen Blast-bittipisteen perusteella. Arkkitehtuurihakuja voidaan suorittaa minkä tahansa genomisen alueiden löytämiseksi, joissa on Blast-osumia mihin tahansa käyttäjän määrittelemään aminohapposekvenssien yhdistelmään.
