| Kustantaja | David Rosenkranz |
|---|---|
| Julkaisupäivä | 6.5.2013 |
| Lisäyspäivämäärä | 6.5.2013 |
| Os vaatimukset | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| Vaatimukset | None |
| Latauksia yhteensä | 64 |
| Hinta | Free |
Kuvaus
proTRAC on ainutlaatuinen ja kätevä työkalu todennäköisyyspohjaiseen piRNA-klusterin havaitsemiseen, visualisointiin ja analysointiin. proTRAC osoittaa korkeampaa herkkyyttä ja selektiivisyyttä verrattuna tähän asti sovellettuihin klusterien havaitsemismenetelmiin. Havaitun sekvenssin lukuosumatiheys, juosteen poikkeama, harvoin kartoitettuja sekvenssilukemia vastaavien lokusten määrä, T-asemassa 1 tai A kohdassa 10 olevien lokusten määrä ja tyypillisellä piRNA-pituusalueella olevien lokusten määrä (26- 32nt) otetaan huomioon. Klusteriehdokkaiden havaitut ominaisuudet arvioidaan annetun tietojoukon valossa ja niihin sovelletaan todennäköisyyspohjaista pisteytysjärjestelmää.