CF

compsort for Mac

Kustantaja: Paul A. Wilson
Mac Free
ladata v1.01 29 latausta
Versio1.01
Kustantaja Paul A. Wilson
Julkaisupäivä25.8.2008
Lisäyspäivämäärä11.8.2004
Os vaatimuksetMacintosh, Mac OS X 10.3
VaatimuksetMac OS X 10.3
Latauksia yhteensä29
HintaFree

Kuvaus

Komentorivityökalu pilkuilla eroteltujen tiedostojen vertailuun käyttämällä suhteellisia eroja samankaltaisimpien konformaatioiden määrittämiseen. Compsort vertaa datatiedostoja käyttämällä suhteellista eroa, laskee samankaltaisuuspisteet, lajittelee pisteet nousevaan järjestykseen (pienemmät arvot edustavat suurempaa samankaltaisuutta), säästää X lukumäärää alhaisia ​​pisteitä.

Käyttäjän tuottamien tiedostojen tulee olla pilkuilla eroteltuja tekstitiedostoja. Jokainen tiedosto edustaa ainutlaatuista molekyyliä. Jokainen tiedoston rivi edustaa molekyylin ainutlaatuista konformaatiota. Datatiedoston ensimmäisen sarakkeen on oltava rivin edustaman konformaation yksilöllinen tunniste. Loput sarakkeet ovat numeerisia kuvaajia, kuten etäisyysavaruusmittauksia.

Rivejä verrataan kombinatorisesti tiedostojen välillä. Vertailutunnisteet ketjutetaan ja tallennetaan rivijoukon pisteisiin. Tämä tarjoaa tavan tunnistaa konformaatiot, jotka tuottivat tietyn samankaltaisuuspisteen.

Tulevaisuuden työhön kuuluu:

graafisen käyttöliittymän lisääminen

lähetän paperia 3D-farmakoforimallinnusalgoritmistani

MPI:tä käyttävä rinnakkaisversio

Samankaltaiset ohjelmat

Vaihtoehdot

Lisää tältä julkaisijalta